circos

용주형의 특명으로 살펴보게된 circos. 사실 알아두면 나중에 필요할 일이 생길거 같다는 느낌에 보게되었다.
circos는 comparative genomics 데이터를 visualization하기 좋은 툴이다. 물론 개발자는 여러다른 예를 들지만..

처음에 메뉴얼 찾는데 웹페이지를 막 뒤지고 다운 받을 수 있는 모든 pdf를 다운 받고 훓어본 결과...
http://mkweb.bcgsc.ca/circos/tutorials/course/ 로 가서 개발자가 여러 컨퍼런스에서 강연했던 자료인 handout이랑 slide에 대한 ppt를 다운 받고 handout은 글이 많으므로 slide만 보면 대충 내용이 파악된다.
xml 처럼(이런게 xml 형식인가?.. 여튼) 그리고자 하는 결과의 component들을 인풋 파일로 정의해주고 이를 태그로 나타내주면 그려주는 형식이다.

개발자의 홈피를 가면 재밌는게 많은거 같은데.. 이 사람.. 색다르다. CSH 에서 나오는 저널중에 하나의 표지도 이사람이 만들었다는데(DNA sequence를 GC content로 색깔을 나타내고 sequence fragment repeat frequency로 curve를 만들어서 그렸는데 보면 무슨 virus를 형광 다이로 염색한 듯한 모습이다).. visualization에 매력을 느끼게 한다.