Friday, August 12, 2011

ncbi genome file extension

NCBI의 genome DB에서 데이터 받으면 여러가지 확장자의 파일들이 있는데 그 설명은 다음 사이트에 잘 나와있다.



.asn	genome record in asn.1 format 
.faa	protein sequences in fasta format, text file
.ffn	protein coding portions of the genome segments
.fna	genome fasta sequence
.frn	rna coding portions of the genome segments
.gbk	genome in genbank file format 
.gff	genome features
.ptt	protein table
.rnt	rna table
.rpt	summary report
.val	binary file (genome project?)
.gb     Genbank?
.gpff   Genbank protein