Monday, July 4, 2011

SRA 데이터 변환 toolkit

안타깝게도.. 
오늘 GMI에서는 네이쳐에 십수명의 사람들의 RNA-Seq 분석해서 보니까 보전적인 RNA-modification 있다는 식으로 논문이 났다는데(아직 논문의 abstract 조차 보지 않았다. 금선생한테 들은거.. 내 조만간 얼마전 science에 나온 RNA-editing 조사한 논문이랑 이 논문이랑 비교해서 포스팅 하리라).. 
본사 마크로젠에서는 RNA-Seq 데이터 조차 찾을 수 없어서.. cufflinks를 이용해 보려 했다만.. 데이터가 없는 관계로 논문의 SRA 데이터 다운 받아서 쓰려는데.. 


뭐 여튼 한없이 안타까운 맘은 뒤로 하고 SRA 데이터 변환 프로그램이 NCBI에서 제공한다. 혹시나 잊어버리지 않을까 하는 맘에 링크를 남긴다.


http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK47540/#SRA_Download_Guid_B.5_Converting_SRA_for