Thursday, May 19, 2011

genome sequencing 정리

genome assembly를 회사에서 시작할려는지 박사님께서 데이터를 하나 보내왔다(구글에서 찾아진다.. 이 말인즉 누구 박사가 어쩌다 하나 찾아서 참고하라고 보냈나싶다).
사실 예전 부터 genome sequencing 부분에서 조금씩 이해가 안가는 부분이 있었는데 이를 확실하게 정리해본다. 첨 human genome sequencing 했을 때 사용됐던 방법이 shotgun sequencing 이랑 bac-to-bac 방식 거기에 대한 소개는 다음에 잘 나와있다. shotgun이야 익숙한데 bac-to-bac은 익숙하지 않다. 특히나 physical mapping 부분은 이해가 되지 않는다(genetics 수업을 제대로 안들었다). 해서 여기를 참조한다(아 요 physical mapping pdf 어렵다.. ).


처음 데이터에 있는 내용은 음.. 각종 시퀀싱 platform을 섞어서 한거 같은데 Bac-by-Bac도 진행해서 굉장히 사용가능한 정보가 많은거 같은데.. ppt 형식만 봐서는 정확히 이해는 가지 않는다. 논문 method를 보지 않는 이상.