이런적이 예전에 있었던거 같은데.. 뭐였지.. HMMER 사용할때.. Pfam 이 버젼 문제가 있었나.. 정확히 기억이 안나는데 여튼..
기억해야 할 한가지가.. HMMER가 version 3까지 나왔는데 종종 HMMER를 사용하는 프로그램이 HMMER 최신 버젼 위주로 되어 있는것이 아니라 예전 걸로 되어 있다.
이번에 rRNA prediction을 위해 RNAmmer (http://www.cbs.dtu.dk/services/RNAmmer/) (뿐만 아니라 genometools 라는 프로그램(tallymer 땜시)도 HMMER2.3.2 버젼을 사용한다)를 셋팅하는데 자꾸 프로그램이 안도는걸 확인했는데.. 몇시간의 뻘짓으로 알아낸게 RNAmmer가 HMMER 2.3.2 버젼으로 되어 있기 때문이라는 것이다. 아.. 진짜.. 이럴 때 너무 싫어..
암튼 주의하길!
