Monday, August 29, 2011

GFF tools

tophat이나 cufflinks 돌릴때 annotation 파일이 필요한데(뭐 꼭 필요한건 아니다. 다만 있으면 더 좋다는 거지).. manual에는 gtf 만 받는거 같지만 update가 되서 gff 파일형식도 받는다. 다만 가끔 annotation이 gbk 파일로 되어 있는데 이를 gff 바꾸기 위한 tool이 gff tools이 되겠다.


link가 tool

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