Thursday, July 7, 2011

Bismark manual 정리

음.. 이 포스팅 역시 보건원 과제에 의한 것으로.. BS-Seq 데이터를 reference에 mapping 할때 쓰는 프로그램인 Bismark의 manual을 정리한 것이다. 일반적으로 BS-Seq 한 논문들 보면 딱히 published 된 프로그램 말고 그냥 reference C->T로 바꾸고 read도 바꾸고 해서 그냥 각종 mapping 프로그램 사용하는데.. 어짜피 내가 짜는 것보단 published 된게 더 나을거 같다 싶어서 가장 최신으로 보이는 Bismark를 사용하기로 한다. 근데 뭐 잘 안맞으면 새로 만들어야 하니까..


사이트는 여기. 음 manual 보니까 Quick reference가 있다.