MBD-Seq, MeDIP-Seq 분석 파이프 라인 구축시 고려 사항 및 참고 논문 등등

이제 ChIP-Seq도 한다. metagenome 하다가 RNA-Seq 하고 다시 De Novo assembly 좀 손대다가 과제가 있어서 ChIP-Seq도 하게 되었다. 좋긴 하다. 많이 보고 이것 저것 해보니. 지루해질 틈도 없다. 다만.. 하나를 깊게 해놓고 끝내지 못하는게 많이 아쉽다. 겉핧기로 논문 보는거 같기도 하고.. 여튼 일에 대한 건 내 결정권 밖이니.. 하는데까지 해보는 수밖에.


일단은 MBD-Seq, MeDIP-Seq 파이프 라인 갖춰야 하고 BS-Seq 도 해야 하는데. 생각이 많다. 뭐를 role model로 해야 하는지. 


일단 MBD-,MeDIP-Seq에서는 Bayesian deconvolution 개념은 확실히 들어가야 할거 같고


MeDIP-Seq 잘 표현한 사이트(여기서도 methylation 분석 파이프 라인 만드는거 같네. 서너명에서 하는거 같은데. 음 좋겠다)