cufflinks

음.. 꼭 해야 하고 봐야 하는건데.. 요즘 완전 좌절과 의욕 상실 모드다. 이게 다 cufflinks 논문 때문이다(논문의 대한 나의 review는 여기). FPKM 개념좀 제대로 이해할려고 cufflinks supplementary를 건들였다가 좌절의 연속으로 내 전문성은 바닥임을 느끼고.. 또한 setup 할려는게 broad institute 의 gene pattern에 이미 너무너무 잘되어 있다는 생각에.. 아.. 한 일주일 정도는 방황하는거 같네.. 아.. 아직도 어떻게 해야 할지 모르겠고 하고 싶은 의욕도 잃은 상태지만.. 가만히 있는건 해결책이 아니라서 cufflinks에 대해 설치 및 output 내용, 사용방법등 읽는 모든 것을 기록하기로 한다. 


<installation>
링크를 보면 source code와 binary code가 있는데 source code로 깔 때 compile error가 나면 화가 나니까 binary code 다운 받고 path만 잡아준다.
그담 테스트 파일 받아서 테스트 해본다.