De Bruijn Graph

genome이건 transcriptome이건 de novo assembly에 사용되는 알고리즘인데..
wiki에 나온건 간단하게 그냥 그 graph의 특징만 나왔다.
그런데 다음 링크는 코드까지 있다. 내 오늘은 그냥 링크만 기록하지만 코드 분석 후에 다시 posting을 하도록 하겠다.


음 코드를 봤는데 생각보다 별게 없다. De bruijn graph를 그리는 것도 아니고.. 링크에 댓글처럼 나도 댓글 달아서 graph까지 그리는 코드를 달라고 해볼까나..


그래서 다른 코드도 찾아봤다.
새로 찾은 블로그는 왠지..


이 코드가 그나마 de bruijn graph를 그리긴 한다. 단.. 거기까지만.. 
visualization 하는 코드도 있는데 xml-rpc인가로 원격으로 하는것 같다.